景炎十四年，清源村中來了一名平凡的少年。村中長者逍遙子見其容貌，知是故人之子。此年恰逢鏡湖五年一次的論劍大會。逍遙子欲借機將其引薦于鏡湖莊主蘇子慕，遂以神兵秘籍相贈，并指點其去桃花源尋找天機門線人采薇。其間少年在顏兒的指點下治好了青姨的沉疴，更幫助彼此有意的菁菁與畫師互傳音訊。

采薇傳授了少年一些基礎的馭獸知識后，就讓其動身前往鳳凰城尋找詩晴。同時告知他菁菁因尋找畫師離開清源村后被青衣人圍困的消息，少年救出菁菁。后經詩晴告知才知道，菁菁遇險可能源于一本名叫《洗天錄》的奇書。凡是與之牽扯上關系的人，無一不遭受青山派的追殺，而久居鳳凰城的李婆婆可能知道一些不為人知的秘密。卻不想李婆婆根本不愿提及此事，卻反請少年幫忙找到孫兒李小遙。從頑皮的李小遙那里，少年結識了聞名桃源的鑄劍大師獨孤一鳴。

旋即少年返回詩晴處探訪菁菁傷勢，得知與《洗天錄》相關的秘密可能隱藏在畫師所贈的一副荷花圖中，但畫師自上次一別就再無音訊。少年只得再次去見獨孤一鳴，并幫其徒仲義平定橫行桃源的惡匪。期間意外遇到了失蹤多年的獨孤一城的點撥，功力大增。后又在桃樹下遇到了等待天機閣少掌門慕少淵的明珠，幾經周折方才查明少淵竟已為青山派所殺。慕少淵曾于三年前離別之時，贈給明珠一本琴譜。為避免睹物傷情，明珠遂將此份琴譜送給了少年，并囑托其向李婆婆稍份口信，告訴其不必擔心。

此次見面李婆婆態度大為緩和，終同意引薦少年去見桃源六仙之一的桃花老人。恰逢桃花老人養的靈鹿走丟了，少年經過努力幫其尋到了小鹿。作為答謝，桃花老人告訴少年，明珠所贈的琴譜不僅僅是份琴譜，而是牽扯到破解《洗天錄》所藏地點的關鍵。少年重新回到桃花源，見到鑄劍大師，得知獨孤一城已經重現江湖，身邊帶著一名白衣少年，名為白羽。此時正在風雪山嶺與青山派僵持不下，讓少年速速前往支援。少年趕到時，發現那里除了白羽，竟然還有天蝶宮的幾名弟子。少年與天蝶梅使用計謀探查出青山派此行目的，原來青山坤位長老名義上要奪取《洗天錄》為青山派洗脫罪名，實際卻想以此書稱霸武林，并且其他青山弟子已在月溪谷有所行動。少年與白羽立即趕往月溪谷。兩人戰勝了月溪谷終年彌漫的桃花瘴氣，又從桃花六仙之二的沈三知那里得到三條錦囊妙計。兩人先取得青山弟子腰牌，潛入月溪谷青山派內部，進而消滅前來滋事的天威甲士，取得了青山大弟子的信任。探知了水沉香的秘密，并成功從青山坤位長老那里奪取了水沉香。加上從小童琥珀和鏡湖弟子凌舞處得到的兩塊，少年將此三塊水沉香帶回獨孤一城處。

水沉香上獨特的銘文讓鑄劍大師想起了一個人。她就是鏡湖山莊的孫婆婆。在婆婆的指點下，少年獨身一人大破鏡湖劍陣，獲得守陣啞奴的許可，打開鳳凰印取走了第四塊水沉香。此時獨孤一城也出現在鏡湖山莊，交代少年將水沉香送至鏡湖莊主處。少年先消滅封鎖道路的天威槍兵，又途中遭遇了青山刺客，一路險象環生，終于平安抵達。卻發現鏡湖莊主憂心重重，原來蘇妃蘇紫顏正在鏡湖省親，眼下局勢動蕩，莊主十分擔心妹妹的安全。少年于是接受了鏡湖莊主的請求，去勸說蘇妃離開鏡湖山莊。卻不想蘇妃臨危不懼，鎮定自若。卻讓少年星夜動身前往王城，叮囑九公主看護好碧龍金璽，以防有人乘機作亂。

九公主告訴少年，她已遣信使去請小潘相商量對策，卻至今不見信使回來。趕到相府后，得知信使已為暗器所傷。原本以為只是普通的王城流匪，卻查出匪徒身上竟然帶有寧王府的天虎令。此時臨近寧王壽辰，寧王正在大肆搜羅壽禮。在為寧王找齊生辰綱、山河圖和廣陵散三份厚禮后，寧王仍然期望請來德高望重的夏黃公和東園公在壽筵上為自己美言幾句，卻反而被兩名老者戲弄一通。后王城禁軍叛亂，少年于亂軍之中救出鏡湖弟子凌思、凌舞。探飄渺峰，訪絕情谷。歷經種種，終成一代大俠。