在文明階段后，就開始太空階段。游戲的目標將以任務方式進行。 

　　玩家將可前往類似地球的星球，或是透過混合物購買的星球修改工具來殖民于不適合居住的星球。要注意的是，修改星球不是像其他編輯器般改造星球，而是用飛船上配塔的武器/修改工具改造。 

　　在探索世界的過程中，玩家可掃描其他物體，并將資料整理成稱為Sporepedia，像是集換式紙牌游戲般的數據庫。 

　　玩家可以采集生物以測試其他星球的可居住性、或是使不同品種雜交、在星球上放置一個巨型石塊（英文原文為monolith）（2001太空漫游所用的稱呼） ，觸發智慧生物的發展，然后等一段時間再回來看發展情況。 

　　在沒有生命的星球，玩家可找到作用不明的特殊工藝品，或許是用來加強UFO之用。 

　　當玩家探索到其他世界，將可進行星際航行，游戲中的銀河將出現超過40億個星球，遠超于任何人一生可以探索的數量。在2007TED專題研討會中，威爾在拉遠視野的銀河中使用時間加速系統，表示整個銀河的動態，就如無限個光點中爆發的超新星，而銀河臂亦緩慢轉動著。他指出星云會依現實分類為行星狀星云和反射星云。他也把UFO駛向黑洞來表示它的引力。 

　　玩家可以接觸其他文明，其中大部份是由其他玩家創造。可以通過移動鼠標來找尋智慧生物的星球系統，也可以收集無線電或聲音。當UFO到達有文明的星球，可以用煙火來給予他們深刻的引象，用武器攻擊，或是用類似第三類接觸中的音樂小游戲來建立一種能和對方溝通的語言。玩家可以用雷射放映生物的全像攝影影片來加深對外星物種的互動。由其他玩家創造的文明將會依據該玩家的培養而有不同的反應和行為。 

　　玩家可以透過外交手段創造一個聯邦或引發星際戰爭來聯合或征服整個銀河。為了彰顯強大的力量，玩家甚至可以使用武器來破壞整個星球（類似星際大戰的死星），但有時會因此被其他物種報復。玩家有時會被喚回去抵抗對母星的侵略。 

　　太空階段也會介紹游戲中主要的壞蛋，Grox帝國（將Borg博格的讀音反轉，博格為Star Trek星際迷航中的物種） ，一個機械物種。是敵是友還沒人知曉。（開始時的關系為-70）

　　老規矩，還是進度條。不過這次通過進度條所要完成的內容非常龐大，通過收集勛章來完成進度條，而勛章共有數百中，其獲取條件多種多樣，大家可對照繁體中文版的說明進行獲取。

　　通訊頻道。太空階段中至關重要的東西。很多內容都要通過這個頻道來展現，包括與下屬的聯絡，與盟友、敵軍、不明外星生物的聯絡等等都要靠它。游戲中一旦看見這個按鈕閃爍就要毫不猶豫地立即點擊。

　　這個任務是練習飛船的操作。很多玩家都卡在這個地方。飛船的操作方式與之前的大不相同，用右鍵點擊地面使飛船移動，而飛船的上升下降要通過鼠標滾輪來完成。星球上的七個城市每個上面都有一圓球，飛臨城市上方用鼠標滾輪降落穿過圓球，完成七個之后，手感也基本上積累得差不多了。

　　探索失落物種。下方的工具欄中，雷達是一個重要道具，一般情況下不需要將其關閉，它會自動探索任務關鍵對象并在飛船下方指出正確方向，且前期能在目標對象頭上以箭頭顯示。同時，如果飛船接近目標的話，雷達的聲音也會變得急促。選中第三項的探索工具，用鼠標左鍵點擊星球上的動植物進行探索。

貨艙頻道。左側的工具是吸收工具，點亮后找到目標動物或植物按住不放即可吸入貨倉。

　　試著將動物投放到城市內。選中要投放的動物之后按住鼠標左鍵即可投放。投放動物時要注意，高度不能太高，且投放過程中不要松開按鍵，不然動物會摔死。植物則不受此限制。

　　武器頻道，目前只有激光可用。此任務是找到五只生病的動物并將其除掉，使用雷達可輕松將其找出，找的過程中也可將高度拔高，注意尋找地面的黃色箭頭。生病的動物會有一團黃色的霧氣圍繞。中后期在殖民星球上若有這種生物的出現會造成該星球生態系統的破壞，必須立即前往將其消滅。當此生物出現時，星球負責人會通過通訊頻道來告知你相關消息。

　　一目了然的交易界面。

　　獲得了第一枚勛章，船長資格勛章。這樣就可以奔向太空了。

通過收集按鈕（黃色箭頭所指示的）可以查看自己的任務目標以及勛章收集狀況。

　　滑動鼠標滾輪使飛船飛向恒星系。

　　飛向Calceall星球，用鼠標左鍵點選該星球即可前往。

　　發現墜毀的太空船。立即前往并以探索工具查看。

　　在此發現了導彈和星際飛行引擎。這下可以沖出太陽系了。

在此界面下繼續滑動鼠標滾輪飛出恒星系。

　　用鼠標左鍵點選，飛往另一個恒星系。

　　發現廢墟。以探索工具查看。

　　被留守的機器人誤認為是GROX帝國的人，辯解無效，只能開打了。這是第一次嘗試將武器指向敵人的機會，練練手吧。

　　每完成一個任務記得回基地看看。這就是標準的通訊頻道界面。在基地維修和充能是免費的，而在殖民星球和中立或盟友勢力處就要收費。

在Vilis星球上設立殖民地。這個星球在另外一個恒星系。

　　使用殖民道具進行殖民。需要注意殖民地必須選擇在礦源附近。

　　尋找外星生命。你可以在其它恒星系找到他們，接近或鼠標移到上面的時候便會有波紋發出。這就是所謂的信號。

　　與外星生命進行交涉。

　　從外星人處也可獲得任務，且報酬十分豐厚。這就是一個消滅生物的任務。

　　為星球涂色的任務。這是個可選的任務，但有一點需要注意，涂色道具共有三種，在道具窗口的左側有三個分別為大氣、山嶺、海洋的圖標，分別對應三種內容的涂色，要全部涂色之后才算完成任務。